La vena dorsal profunda del pene drena la sangre sin oxígeno del glande, que es la cabeza externa del órgano sexual.
Esta vena se extiende a lo largo del eje y finalmente fluye hacia el plexo venoso prostático cerca de la glándula prostática de un hombre. A partir de ahí, la sangre desoxigenada debe viajar a través del sistema venal hasta llegar al centro del sistema circulatorio para reabastecerse de oxígeno en los pulmones y recircularse a través del lado izquierdo del corazón.
La vena no es lo mismo que una arteria con un nombre similar, que transmite sangre oxigenada al glande. Sin embargo, la vena dorsal profunda del pene corre un curso cerca de su contraparte arterial.
También corre directamente debajo de la vena dorsal superficial del pene. Sin embargo, una capa de fascia profunda (tejido conectivo) separa los dos vasos sanguíneos venosos.
Dado que el pene es exclusivo de la anatomía masculina, ambas venas también son exclusivas del cuerpo masculino. Para fines comparativos, la relación más cercana en el cuerpo femenino incluiría las venas que sirven al clítoris.